Ao longo da história, o colégio já formou centenas de milhares de crianças e jovens à luz dos valores cristãos e mantém o comprometimento com uma educação de qualidade, inovadora e transformadora.
A diretora conta que há diversos ex-alunos que se destacam em diferentes setores da sociedade. "Poderíamos elencar muitos nomes, mas correríamos o risco de esquecer alguém e cometeríamos injustiça", diz ela.
Com uma área de 12.000m2, o colégio possui um espaço exclusivo para a Educação Infantil, drive para entrada e saída de veículos, salas de aula amplas, climatizadas e com todos os recursos tecnológicos, além de 3 quadras poliesportivas -sendo uma coberta-, laboratórios e muito mais.
A escola oferece opções de ensino da educação infantil ao ensino médio, que agora conta com os novos itinerários formativos de acordo com a BNCC, Período Integral e Ensino Bilíngue.
A qualidade acadêmica aliada à formação humanista integral sempre foram os pontos fortes da proposta pedagógica do São José. O Poliedro, material didático utilizado, é referência nacional, reconhecido pelos excelentes resultados de aprovações nos vestibulares mais concorridos como o ENEM.
A história do Colégio São José começou quando Madre Maria Teodora Voiron, superiora provincial da época, percebeu que em Santos havia uma carência de escolas para meninas.
Em 1° de fevereiro de 1924, foram iniciadas as aulas no Colégio São José na rua Dr. Chrome, 53. O trabalho foi organizado por Irmã Maria Simpliciana e mais 4 Irmas, Irmã Maria Leontina Amstalden, Maria Leticia de Jesus Franzen, Maria Edith Renaudin e Guilhermina, que, acolhidas pela família Vaz Guimarães, começaram uma escola pequena.
Devido ao número de estudantes, em abril de 1925, o Colégio São José passou a funcionar no atual endereço com 90 alunas.
Em 1926 foi criado o curso Complementar, com classes especiais até 7a, 8a, 9a séries.
Em fevereiro de 1929 foi criada a Escola Normal Livre tendo formado a primeira turma, com 22 professoras, em dezembro de 1932.
Em 1935 foi instalado o curso de Comércio, que esteve em atividade até 1955.
Em 1943 começou a funcionar o 2° ciclo, Colegial Clássico e Científico.
Em 1953, então sob a Direção de Madre Albertina, foi inaugurada a Capela do Colégio São José, uma das maiores da Diocese de Santos.
Em 19 de março de 1957, deu-se a fundação da Associação das Ex-Alunas do Colégio São José, hoje Associação Promocional São José.
Em seus anos de existência, o Colégio São José tem mantido sempre vivos os seus mais caros ideais, ou seja, a formação integral, física, social, humana e cristã dos alunos, com o fim de levá-los, enquanto agentes de sua própria educação, a libertação na renovação da família, da sociedade e da Igreja (art. 4° do Regimento Interno).